proTRAC

描述

proTRAC 是用于概率 piRNA 簇检测、可视化和分析的独特且方便的工具。与迄今为止应用的聚类检测方法相比，proTRAC 显示出更高的灵敏度和选择性。观察到的序列读数命中密度、链偏差、与不经常映射的序列读数相对应的基因座数量、位置 1 为 T 或位置 10 为 A 的基因座数量以及典型 piRNA 长度范围内的基因座数量（26- 32nt) 被考虑在内。观察到的聚类候选特征根据给定的数据集进行评估，并服从概率评分系统。