MultiGeneBlast

描述

MultiGeneBlast 是一个开源工具，它基于重新格式化 NCBI GenBank 蛋白质条目的 FASTA 标头，使用它可以追踪它们的源核苷酸和坐标。 MultiGeneBlast 可以帮助检测合成生物学项目中的这种多基因部分。可以根据其输出创建一个合成的操作子库，以识别那些功能最接近用户所需功能的操作子。该工具提供了识别所有同源基因组区域的机会，方法是结合单个 BlastP 在每个基因上运行的结果，并根据命中数、同线性保守性和累积 Blast 位得分对来自任何 GenBank 条目的基因组区域进行排序。可以执行体系结构搜索以查找与任何用户指定的氨基酸序列组合的 Blast hits 的任何基因组区域。